Музей расположился в бывшем губернаторском доме. С августа 1917 по апрель 1918 года, до высылки в Екатеринбург, здесь содержалась под арестом царская семья. 26 апреля
В экспозиции музея уникальные вещи, относящиеся к периоду нахождения здесь царской семьи: мебель, иконы, шелковая шаль императрицы Александры Федоровны, Евангелие с ее штампом и автографом, семейный фотоальбом, «волшебный фонарь» для проекции изображений, принадлежавший цесаревичу Алексею, и другие экспонаты.
Музей стал центром экскурсионной программы в Тобольске туристского проекта «Императорский маршрут». Он реализуется под эгидой Министерства культуры совместно с фондом